Ahoj,
1) Tohle upřímně netuším, je možné, že to Kosmos už má bricmii jako výchozí - buďto vyzkoušej, nebo třeba odpoví někdo další.
2) Ano, injectnout payload musíš vždycky po opětovném spuštění Switche.
3) Prosím, upřesni, nějak nevím, na co konkrétně se ptáš
4) To je na tobě - pokud necháš "Disable", budeš muset v Hekate zvolit bootování CFW. Tímhle krokem to můžeš zautomatizovat.
5) Vidět budou, ale bez CFW se budou hlásit jako poškozené - nepůjdou tedy spustit.
6) Homebrew aplikace stáhneš (prakticky kdekoliv) jako soubor s koncovkou .nro. Ten stačí na kartu přidat/smazat dle uvážení. V Kosmosu, co si dobře pamatuji, updater přímo je - pro připojení ke stažení updatů přes WiFi použij 90dns (je to DNS, která znemožní spojení s Nintendo servery, ale internet ti stále půjde).
Pro EmuNAND je potřeba udělat pár dalších kroků, návod zde prozatím není, časem bych i ten rád udělal.
Omlouvám se, pokud jsem na něco neodpověděl, psal jsem to v rychlosti, tak prozatím takhle.